有机肥主要来源于植物或动物残体粪便（猪牛羊鸡粪等）经过工艺加工过发酵无害后的一种肥料，施在土壤中给植物提供营养的一种含碳物料。

其实，只要是含有碳源的物质都可以成为有机肥，包括饼肥、堆肥、沼肥、菌肥等等，如果从制作方式来说的话，分为天然有机肥、有机复合肥、生物有机肥等。而生物有机肥是菌肥的一种，具有特定功能的微生物和主要以动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源，并经过无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的。它在商品生产过程中，主要是利用微生物的发酵和分解，从而能够达到充分分解、杀菌的目的。

通常把含有较多的有机质，来源于动植物有机体、畜禽粪便等废弃物的肥料都叫作有机肥料。但是我们在市面上买的有机肥都是已经完全腐熟过的有机肥，是一种能够改善土壤理化性状的有益微生物，无臭味，易运输的商品肥料。

有机肥能给作物的生长提供各种养分，虽然有机肥的肥效速度慢，但是肥效持久，还能够改良土壤结构，增加土壤的活性，能为农作物提供化肥所不能提供的营养物质。

农家肥是农家自己种、养、积制的农家有机肥，主要有绿肥、厩肥、堆沤肥。没有经过完全腐熟农家肥，无害化程度低、残留有大量的有害病菌、病毒、虫卵、杂草种子，易烧根苗，不易被作为商品肥料销售。

菌肥包括菌剂、生物有机肥、复合微生物肥料。菌肥的主要作用是由活菌决定的，分解土壤里面的营养物质变成植物能够吸收的养分。

菌肥效果的好与坏体现在菌群的环境与活性，要想生物菌肥达到良好的改良土壤及延长土壤使用寿命效果，必须保证菌体为活体状态，并且能够不断地进行繁殖。

生物有机肥是菌肥的一种，是完全腐熟的，相比较农家肥来说，它的虫卵死亡率达到95%以上对作物来说比较安全，而且也没有农家肥的臭味，肥料比较均匀，我们施用起来也比较方便。